Afaik können nicht zwei Firefox-Instanzen gleichzeitig laufen (eine Instanz kann aber mehrere Fenster umfassen). Habe ich, glaube ich, irgendwo mal gelesen, finde die Quelle aber jetzt nicht mehr.
Falls es dir nur um die Lesezeichen geht, hilft dir vielleicht aber die
Foxmarks Bookmark Synchronizer-Extension weiter.
[Edit]Hab doch was gefunden:
http://www.firefox-browser.de/wiki/MOZ_NO_REMOTE [/Edit]
Das "Hardware sicher entfernen"-Problem habe ich auch (Windows bietet mir immer freundlicherweise an meine SATA-Systemplatte zu entfernen^^). Man kann zwar über Rechtsklick Taskleiste, Eigenschaften, "Inaktive Symbole ausblenden" das Symbol ausblenden, aber dann hat man diesen blöden Pfeil, den ich nicht mag. Eine andere Lösung kenn ich leider auch nicht...